故事依托于《机甲世纪》的背景故事展开，联邦和同盟间的星际之战把地球和火星破坏的满目创痍，终于人类被疯狂的战争推到了毁灭的边缘，正反物质湮灭的风暴席卷星系，在这危急的时刻，神秘的“方舟”拯救了人类文明，获得这来之不易和平的人类，为了抚平战争的创伤，为了让几近凋零的文明之花再次绽放，人类展开了向着未知星系的远航，寻找新的家园。